Sihtasutuse tegevust kavandab nõukogu. Nõukogu korraldab ka Sihtasutuse juhtimist ja teostab järelevalvet selle tegevuse üle. Nõukogu koosseisu kuulub kuni 13 liiget, kes määratakse asutaja poolt kolmeks aastaks.

Nõukogu koosseisus muudatuste tegemise ning nõukogu liikmete tagasikutsumise otsustab asutaja. Nõukogu nõusolek on juhatusele vajalik tehingute tegemiseks, mis väljuvad igapäevase majandustegevuse raamidest. Oma ülesannete täitmiseks on nõukogul õigus tutvuda kõigi Sihtasutuse dokumentidega ning kontrollida raamatupidamise õigsust, varade olemasolu, samuti Sihtasutuse tegevuse vastavust seadusele ja põhikirjale.

Integratsiooni ja Migratsiooni Sihtasutuse Meie Inimesed nõukogu koosseis:

Laine Randjärv - Riigikogu aseesimees

Anne-Ly Reimaa - Kultuuriministeeriumi asekantsler
Irene Käosaar - Haridus- ja Teadusministeeriumi üldharidusosakonna juhataja
Ruth Annus - Siseministeeriumi migratsiooni- ja piirivalvepoliitika osakonna juhataja
Vitali Gaitšonok - Isamaa ja Res Publica Liidu fraktsiooni nõunik
Paul-Eerik Rummo - Riigikogu liige
Mart Nutt - Tallinna Linnavolikogu liige
Kaie Koskaru - Rahandusministeeriumi Riigieelarve osakonna osakonnajuhataja kohusetäitja